Molecular epidemiology and phylogenetic analysis of human papillomavirus infection in women with cervical lesions and cancer from the coastal region of Ecuador / Epidemiología molecular y análisis filogenético de la infección por el virus del papiloma humano en mujeres con lesiones cervicales y cáncer en la región litoral del Ecuador

The aim of the present study was to gather information regarding the molecular epidemiology of Human papillomavirus (HPV) and related risk factors in a group of women with low- and high-grade cervical lesions and cancer from the coastal region of Ecuador. In addition, we studied the evolution of HPV variants from the most prevalent types and provided a temporal framework for their emergence, which may help to trace the source of dissemination within the region. We analyzed 166 samples, including 57 CIN1, 95 CIN2/3 and 14 cancer cases. HPV detection and typing was done by PCR-sequencing (MY09/MY11). HPV variants and estimation of the time to most recent common ancestor (tMRCA) was assessed through phylogeny and coalescence analysis. HPV DNA was found in 54.4% of CIN1, 74.7% of CIN2/3 and 78.6% of cancer samples. HPV16 (38.9%) and HPV58 (19.5%) were the most prevalent types. Risk factors for the development of cervical lesions/cancer were the following: three or more pregnancies (OR = 4.3), HPV infection (OR = 3.7 for high-risk types; OR = 3.5 for HPV16), among others. With regard to HPV evolution, HPV16 isolates belonged to lineages A (69%) and D (31%) whereas HPV58 isolates belonged only to lineage A. The period of emergence of HPV16 was in association with human populations (tMRCA = 91 052 years for HPV16A and 27000 years for HPV16D), whereas HPV58A preceded Homo sapiens evolution (322 257 years). This study provides novel data on HPV epidemiology and evolution in Ecuador, which will be fundamental in the vaccine era.

El objetivo del presente estudio fue aportar información sobre la epidemiología molecular del virus del papiloma humano (human papillomavirus [HPV]) y los factores de riesgo asociados al desarrollo de lesiones cervicales y cáncer en mujeres de la costa del Ecuador. Además, se estudiaron la evolución de las variantes de los HPV más prevalentes y el marco temporal de su emergencia, para ayudar a rastrear la fuente de dispersión en la región. Se analizaron 166 muestras, incluyendo 57 y 95 casos de neoplasia intraepitelial cervical tipo 1 (CIN1) y tipo 2/3 (CIN2/3), respectivamente, y 14 de casos de cáncer. La detección/tipificación de HPV se realizó por PCR-secuenciación (MY09/MY11). La caracterización de variantes y la datación del ancestro común más reciente (tMRCA) se realizaron mediante filogenia y coalescencia. Se encontró ADN de HPV en el 54,4% de las muestras de CIN1, el 74,7% de las muestras de CIN2/3 y el 78,6% de las muestras de cáncer. Los tipos HPV16 (38,9%) y HPV58 (19,5%) fueron los más frecuentes. Los factores de riesgo para el desarrollo de lesiones cervicales/cáncer fueron 3 o más embarazos (OR = 4,3) e infección por HPV (O = 3,7 para HPV de alto riesgo, OR = 3,5 para HPV16), entre otros. En cuanto a la evolución viral, los aislados del HPV16 pertenecían a los linajes A (69%) y D (31%), mientras que los aislados del HPV58 pertenecían únicamente al linaje A. El período de emergencia del HPV16 estuvo asociado a poblaciones humanas (tMRCA = 91.052 años para HPV16Ay 27.000 para HPV16D), mientras que el del HPV58A precedió a la evolución de Homo sapiens (322.257 años). Este estudio proporciona datos novedosos sobre la epidemiología y la evolución del HPV en Ecuador, los cuales serán fundamentales en la era de la vacuna.

Molecular evidence of high-risk human papillomavirus infection in colorectal tumours from Cuban patients

The association between colorectal cancer and human papillomavirus (HPV) infection is still unproven. The aim of this study was to investigate the presence of high-risk HPV (HR-HPV) DNA in colorectal tissues from Cuban patients. A total of 63 colorectal formalin-fixed paraffin-embedded tissues were studied (24 adenocarcinoma, 18 adenoma, and 21 colorectal tissues classified as benign colitis). DNA from colorectal samples was analysed by quantitative real-time polymerase chain reaction to detect the most clinically relevant high HR-HPV types (HPV-16, -18, -31, -33, -45, -52, and -58). Associations between histologic findings and other risk factors were also analysed. Overall, HPV DNA was detected in 23.8% (15/63) of the samples studied. Viral infections were detected in 41.7% of adenocarcinoma (10/24) and 27.7% of adenoma cases (5/18). HPV DNA was not found in any of the negative cases. An association between histological diagnosis of adenocarcinoma and HPV infection was observed (odd ratio = 4.85, 95% confidence interval = 1.40-16.80, p = 0.009). The only genotypes identified were HPV 16 and 33. Viral loads were higher in adenocarcinoma, and these cases were associated with HPV 16. This study provides molecular evidence of HR-HPV infection in colorectal adenocarcinoma tissues from Cuban patients.

Seroprevalence of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus in various populations in Cuba

OBJETIVO: Se sabe poco acerca de la prevalencia y distribución en el Caribe de la infección por el herpesvirus asociado con el sarcoma de Kaposi (HVSK). El objetivo del presente estudio fue determinar las tasas de seropositividad a HVSK en diversas poblaciones en Cuba. MÉTODOS: Durante el período de 1998 a 2002 se examinaron muestras de suero de 410 personas en Cuba. El tamizaje serológico de los anticuerpos contra HVSK se realizó en dos pasos con las siguientes técnicas: 1) ensayo de inmunofluorescencia indirecta (IFI) con reactividad específica a la porción del antígeno de HVSK asociado a la latencia (ANAL) que está codificada por la plantilla de lectura abierta 73 (ORF73), y 2) inmunoblot (Western) confirmatorio, usando como antígeno blanco la proteína ORF65.2 de HVSK recombinante, que tiene 20 kilodaltones y se expresa durante la infección lítica. Cinco poblaciones diferentes fueron estudiadas: 1) 45 pacientes de sida con sarcoma de Kaposi (sida-KS); 2) 154 pacientes infectados por VIH-1 pero sin signos clínicos de sarcoma de Kaposi (SK); 3) 171 donantes de sangre con seronegatividad a VIH; 4) 27 receptores consecutivos de transplantes renales con seronegatividad a VIH y 5) 13 contactos (sexuales o por parentesco) de los pacientes de sida con SK. RESULTADOS: De las 45 personas con sida y SK, 35 (77,8%) mostraron seropositividad a HVSK. Treinta y dos (20,8%) de los 154 pacientes con seropositividad a VIH pero sin SK mostraron seropositividad a HVSK, y 6 de los 13 contactos (46,2%) de pacientes con SK estaban infectados por HVSK. A diferencia de otros investigadores, los autores del presente estudio no encontraron ninguna asociación entre la seropositividad a HVSK y la actividad homosexual o bisexual en personas de sexo masculino en las poblaciones cubanas estudiadas. En cambio, sí hallaron tasas elevadas de seropositividad a HVSK en mujeres que declararon haber tenido contacto sexual con hombres bisexuales y en hombres que habían adquirido la infección por VIH en el África. Las tasas de infección por HVSK fueron bajas en los donantes de sangre (1,2%) y en los receptores de transplantes renales (0,0%). Las tasas de infección por HVSK halladas en las poblaciones cubanas sin infección por VIH fueron tan bajas como las observadas en Europa y Estados Unidos de América. CONCLUSIONES: Nuestros resultados, sumados a otros resultados parecidos obtenidos en Brasil, Estados Unidos y Jamaica, indican que la infección por HVSK es poco frecuente en algunas...

Prevalence of Chlamydia trachomatis in human immunodeficiency virus-infected women in Cuba

To determine the prevalence rates and serovar distribution of Chlamydia trachomatis cervical infections in Cuban women, two different groups were selected. Group I consisted of 60 human immunodeficiency virus (HIV-1) seropositive women from different regions of Cuba and group II of 60 randomly selected women HIV seronegative and apparently healthy. C. trachomatis was detected in cervical scrapes by mean of nested polymerase chain reaction (PCR) specific for major out membrane protein. The overall prevalence rate of C. trachomatis in cervical scrapes determined by nested PCR was 10 percent in group I and the estimated prevalence was 6.6 percent for group II; 83.3 percent of HIV seropositive women with C. trachomatis infection reported history of pelvic inflammatory disease followed by cervicitis (50 percent). The control group C. trachomatis-infected women referred a history of cervicitis in 75 percent of cases. Other reports in the latter group included infertility and pelvic inflamatory disease in 50 percent. The present study is the first report of C. trachomatis prevalence in Cuba. It showed that there was not significantly difference in the prevalence rate of C. trachomatis between both groups

Detección de Chlamydia trachomatis en muestras de exudado endocervical por la reacción en cadena de la polimerasa / Detection of Chlamydia trachomatis in samples of endocervical exudate by polymerase chain reaction

Se procesaron 59 muestras de exudado endocervical, de mujeres que asistieron a 2 clínicas de infertilidad y a consulta de regulación menstrual de Ciudad de La Habana, para evaluar el desempeño de un método de detección de Chlamydia trachomatis, basado en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con cebadores KL1 y KL2, específicos para el plásmido. Las muestras se ensayaron por PCR-plásmido, por cultivo de células y por otro método de PCR basado en la amplificación de una región de la proteína principal de la membrana externa (MOMP) de la Chlamydia, este se utilizó como ensayo confirmatorio. Se comprobó que en 43 muestras los resultados coincidían entre el cultivo y el PCR-plásmido: 4 positivas y 39 negativas. Las 16 restantes brindaron resultados discordantes. Se les realizó un estudio de inhibición a las 8 muestras cultivo positivas/PCR-plásmido negativas y se comprobó que 2 de ellas presentaban inhibidores, cuya acción fue revertida al adicionar BSA a la mezcla de reacción. De las 8 discordantes, cultivo negativo/PCR-plásmido positivas, 5 se confirmaron como positivas después del procesamiento por PCR-MOMP. Tomando como criterio de verdadero positivo la coincidencia de al menos 2 de los 3 métodos ensayados, se obtuvo sensibilidad del 100(por ciento) y especificidad del 94(por ciento) para el PCR-plásmido en comparación con el 54 y 87(por ciento), respectivamente para el cultivo. El PCR-plásmido presentó un valor predictivo positivo de 79(por ciento) y negativo de 100(por ciento), mientras que para el cultivo fue de 50 y 89(por ciento), respectivamente. Se demostró que el PCR- plásmido, en nuestras condiciones de laboratorio, brinda resultados confiables en el diagnóstico de la Chlamydia en muestras de exudado endocervical(AU)

59 samples of endocervical exudate from women that were seen at infertility clinics and at the consultation room of menstrual regulation, in Havana City, were processed to evaluate the performance of a method to detect Chlamydia trachomatis, based on polymerase chain reaction (PCR) with primers KL1 and KL2 specific for the plasmid. The samples were assayed by PCR-plasmid, by cell culture and by another method of PCR based on the amplification of a region of the main protein of the external membrane (MOMP) of Chlamydia, which was used as a confirmatory trial. It was observed that in 43 samples the results of the culture and of the PCR-plasmid coincided: 4 positive and 39 negative. The other 16 had discordant results. An inhibition study was conducted in the 8 culture negative/PCR-plasmid positive samples and it was proved that 2 of them had inhibitors, whose action was reverted on adding BSA to the reaction mixture. Of the 8 negative culture/positive PCR-plasmid discordant samples, 5 were confirmed as positive after being processed by PCR-MOMP. Taking the coincidence of at least 2 of the 3 assayed methods as a positive true criterion, 100 percent of sensitivity and 94 percent of specificity were obtained for PCR-plasmid compared with 54 percent and 87 percent for the culture, respectively. The PCR-plasmid presented a positive predictive value of 79 percent and a negative predictive value of 100 percent; whereas the culture had 50 percent and 89 percent, respectively. It was proved that the results of the PCR-plasmid under our laboratory conditions are reliable in the diagnosis of Chlamydia in samples of endocervical exudate(AU)

Prevalencia de anticuerpos contra virus herpes simple, virus Epstein-Barr y citomegalovirus en un grupo de pacientes con hemodiálisis realizada / Prevalence of antibodies against herpes simplex virus, Epstein-Barr virus and cytomegalovirus in a group of patients after hemodialysis

Infections from herpes virus play a key role in post-transplantation pathology, so it is indispensable to characterize the group of would-be renal transplant recipients. IgG antibody titers were detected by indirect immunofluorescence to Herpes simplex virus, Epstein Barr virus (EBV) and cytomegalovirus (CMV) in 100 patients treated with hemodialysis in the Nephrology Institute. The prevalence of antibodies to cytomegalovirus and to Herpes simplex and Epstein Barr viruses was 100 and 95 respectively. Average geometric titers (AGT) of antibodies to CMV were significantly higher. There was no correlation between AGT and sex, age, time of disease remission, number of blood transfusions and number of transplants.

Detección de herpesvirus en pacientes inmunocomprometidos con meningoencefalitis, mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa / Detecction of herpesvirus in patients immunocompromised with meningoencephalitis by polymerase chain reaction

Se utilizó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (RCP) múltiple para detectar, en un solo tubo de reacción, la presencia del virus de herpes simple (VHS), citomegalovirus (CMV), virus de Epstein Barr (VEB), virus de la varicela zóster (VVZ) y/o el virus del herpes humano 6 (VHH6). Cincuenta líquidos cefalorraquídeos de pacientes con el síndrome de inmunodeficiencia adquirida y con sospecha clínica de meningoencefalitis por el VHS, recibidos en el Laboratorio de Enfermedades de Transmisión Sexual del Departamento de Virología del Instituto de Medicina Tropical "Pedro Kourí" entre los años 1993 y 1996 fueron analizados; de estos,4 resultaron positivos al VHS, 3 a CMV, 2 al VVZ y 1 al VHH6, para 20 por ciento de positividad. Se correlacionaron los resultados de la RCP con los hallazgos clínicos que presentaban los pacientes en el momento que se les realizó la punción lumbar. La introducción de esta técnica en el laboratorio permite contar con una herramienta útil, por su sencillez y rapidez para el diagnóstico de las meningoencefalitis por herpesvirus

Estudio serológico evolutivo a herpes simple y citomegalovirus en pacientes cubanos infectados con el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) / Serological study of herpes simplex and cytomegalovirus in VIH infected Cuban patients

Se estudió la respuesta serológica evolutiva frente a los virus herpes simple y Citomegalovirus en pacientes infectados con el VIH, agrupados en diferentes estadios de la enfermedad. Se observaron fluctaciones en los TPG de anticuerpos contra HSV en el grupo de pacientes asintomáticos con respecto a los pacientes SIDA y a los fallecidos. Existe una marcada caída en el TPG de anticuerpos contra HSV y CMV aproximadamente 1 año antes del fallecimiento de los pacientes

Estudio de la respuesta serológica a algunos Herpevirus en un grupo de pacientes infectados con el VIH / Study of the serological response to certain Herpes viruses in a group of patients presenting with HIV infection

Se determinaron los títulos de anticuerpos al virus del herpes simple (VHS), Citomegalovirus (CMV) y antígeno de la cápsula viral (ACV) del virus Epstein Barr (VEB) en muestras de suero provenientes de pacientes infectados con el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), pertenecientes a los grupos II (n=26= y IV (n=32) de acuerdo con el sistema actual de clasificación de la infección por VIH, así como un grupo de donantes de sangre (n=52=. LOs títulos promedio geométricos (TPG) obtenidos a diferentes agentes fueron muy elevados en los pacientes infectados con VIH con respecto a los TPG observados en los donantesñ los pacientes del grupo II tuvieron títulos a ACV del VEB significativamente más elevados que los donantes de sangre. Los niveles de anticuerpos a estos agentes en los pacientes del grupo IV fueron más elevados que los niveles obtenidos en los donantes, notándose que las diferencias en cuanto a los niveles de ACV del VEB fueron altamente significativas. Estos resultados indican la posible importancia de la infección por VEb en la historia natural del síndrome de inmunodeficiencia adquirida